Phùng Phụng Thế có tất cả 13 người con gồm 9 đứa con trai và 4 cô con gái.

Con trai

• Trưởng nam Phùng Đàm (馮谭), ban đầu được tiến cử hiếu liêm ra làm Lang, về sau triều đình bổ nhiệm chức Tư mã Thiên Thủy. Lúc Phùng Phụng Thế chinh phạt Tây Khương, Phùng Đàm làm giáo úy, theo cha tòng quân lập công, chưa kịp trao chức quan thì mắc bệnh qua đời.
• Con thứ Phùng Dã Vương (馮野王), tên tự là Quân Khanh, Đại hồng lô, nối tước cha làm Quan Nội hầu, sau bị bãi chức. Dã Vương có một người con dâu tên Quân Chi (君之), chồng là em trai Phùng Viện, lúc xảy ra vụ Phùng Viện đã góa bụa, bị tội liên lụy mà chết.
• Con thứ Phùng Thuân (馮逡), tên tự là Tử Sản, Thái thú Lũng Tây.
• Con thứ Phùng Lập (馮立), tên tự là Khánh Thanh, Thái thú Thái Nguyên.
• Con út Phùng Tham (馮参), tên tự là Thúc Bình, Gián đại phu, lĩnh chức Hộ tả Phùng dực đô thủy, Nghi Hương hầu, sau giáng làm Quan Nội hầu, vì liên lụy tới vụ người chị cùng mẹ là Phùng Viện nên tự sát.

Bốn người còn lại không rõ danh tính.

Con gái

• Trưởng nữ Phùng Viện (馮媛), phi tần thời Hán Nguyên Đế (漢元帝), sinh ra Trung Sơn vương Lưu Hưng (劉興), cha của Hán Bình Đế (漢平帝).
• Con thứ Phùng Tập (馮習), vì liên lụy tới vụ Phùng Viện, cả nhà tự sát hoặc bị giết.

Hai người còn lại không rõ danh tính.